MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187112	CTC	2	6	37	42	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187112	CTT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187112	CGG	2	6	105	110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187112	GTT	2	6	121	126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187112	GTG	2	6	135	140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187112	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187112	A	8	8	184	191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187112	ACA	2	6	213	218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187112	CTC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187112	ATT	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187112	AAAG	2	8	2961	2968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187112	CTT	2	6	4716	4721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187112	CTT	2	6	5716	5721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187112	AAT	2	6	5766	5771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187112	CA	3	6	5783	5788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187112	T	6	6	6230	6235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187112	GTACT	2	10	6260	6269	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187112	TTC	2	6	6310	6315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187112	T	6	6	6322	6327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187112	AAG	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187112	T	6	6	6409	6414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187112	A	6	6	6424	6429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187112	A	6	6	8485	8490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187112	TCA	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187112	AAC	2	6	9648	9653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187112	TCC	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NT_187112	ACA	2	6	10890	10895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187112	ATT	2	6	10901	10906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187112	T	6	6	10952	10957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187112	ATT	2	6	10959	10964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187112	T	6	6	10963	10968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187112	CA	3	6	10974	10979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187112	ATT	2	6	11051	11056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187112	AAT	2	6	11092	11097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187112	ACAA	2	8	11109	11116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187112	TGG	2	6	11151	11156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187112	A	6	6	12986	12991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187112	CTT	2	6	13014	13019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187112	AACA	2	8	13085	13092	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187112	AAC	2	6	13109	13114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187112	TTC	2	6	14252	14257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187112	GTA	2	6	14259	14264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187112	CAA	2	6	14299	14304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187112	CTG	2	6	14337	14342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187112	AT	3	6	14358	14363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187112	T	6	6	14375	14380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187112	CT	3	6	14390	14395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NT_187112	TAC	2	6	14483	14488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187112	TCA	2	6	14499	14504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187112	TAT	3	9	14524	14532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187112	T	6	6	14567	14572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187112	CAA	2	6	14596	14601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187112	AGT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187112	AAT	2	6	14642	14647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187112	CAC	2	6	15700	15705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NT_187112	ACA	2	6	15721	15726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187112	CTT	2	6	17200	17205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187112	T	7	7	20934	20940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187112	GGGA	2	8	20994	21001	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187112	GCA	2	6	21032	21037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187112	TG	3	6	21048	21053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187112	GAT	2	6	21162	21167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187112	T	6	6	21169	21174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187112	CGC	2	6	21430	21435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187112	AAC	2	6	21472	21477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187112	AC	3	6	21533	21538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187112	TGA	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187112	TAAA	2	8	21594	21601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187112	AAC	2	6	21877	21882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187112	TC	3	6	21934	21939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187112	CGT	2	6	22302	22307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187112	TTG	2	6	22324	22329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187112	TGG	2	6	22339	22344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187112	TGG	2	6	22385	22390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187112	GCC	2	6	22405	22410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NT_187112	GGC	2	6	22416	22421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187112	TGT	2	6	25315	25320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187112	GTC	2	6	25336	25341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187112	TGG	2	6	25344	25349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187112	CAGAA	2	10	26276	26285	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NT_187112	GGC	2	6	26290	26295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187112	CCCG	2	8	26299	26306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.